Le programme de master en sciences médicales repose sur des disciplines théoriques, méthodologiques et didactiques-pédagogiques interdépendantes, qui offrent le soutien nécessaire à la formation des enseignants et des chercheurs. Il vise à développer la pensée critique et scientifique, en renforçant les projets et les axes de recherche qui y contribuent. Le mémoire de fin d'études est élaboré selon les domaines de spécialisation.

La structure du programme de maîtrise en sciences médicales repose sur trois piliers de formation : (1) la formation technique, selon le domaine de concentration du programme ; (2) la formation scientifique ; et (3) la formation des enseignants.

Cette stratégie vise à atteindre les objectifs du programme en formant des professionnels hautement qualifiés pour une pratique clinique, pédagogique et scientifique de pointe, capables d'agir de manière transformatrice dans la société par le biais de l'enseignement, du développement de pistes de recherche et de la planification et de la mise en œuvre de politiques publiques adaptées aux besoins sociaux.

Les disciplines qui composent le Master en sciences médicales ont été conçues pour une intégration étroite entre la structure des programmes d'études des domaines de spécialisation et le renforcement des axes de recherche.